Este relieve es una de las seis esculturas que se conservan del retablo inacabado proyectado en 1575 para la cabecera de la iglesia de San Miguel de Vitoria-Gasteiz. El contrato de este fallido retablo recayó sobre Esteban de Velasco ya que prometió traer uno de los mejores escultores del momento, a Juan de Anchieta, pero tres años más tarde dejó la obra en manos de Anchieta, quien firmó un segundo contrato en 1578 en compañía del salvaterrano Lope de Larrea y empezó a trabajar sobre la traza diseñada por el arquitecto Íñigo de Zárraga.
A lo largo del tiempo, el relieve ha tenido varias ubicaciones dentro de la iglesia de San Miguel. Sabemos documentalmente que en 1601 estuvo instalado en el altar y que en 1632 se desmontó y se vendió a la Capilla de las Candelas. Allí permaneció hasta 1922 cuando se trasladó a la sacristía. Finalmente, en 1999 ingresa en el Museo Diocesano de Arte Sacro junto a los otros tres relieves y en 2010 se reúnen todas las piezas conservadas del inacabado retablo: dos tallas de San Miguel y San Pablo y los cuatro relieves de la Flagelación, la Coronación, Moisés y David.
La escena representada, la Flagelación de Jesús, pertenece al Ciclo de la Pasión y describe el momento en el que los sayones azotan a Cristo una vez atado a la columna. El cuerpo de Cristo de potente anatomía modelada con blandura, se muestra casi desnudo en primer plano y organiza la composición, resuelta con maestría. En actitud contrapuesta se sitúan los soldados para crear profundidad, uno de espaldas y otro de frente, y proporcionan además dinamismo con sus gestos serpenteantes. Para componer la escena y los personajes Ancheta se inspiró en un dibujo de Miguel Ángel que se conserva en el Castillo del Windsor. La huella miguelangelesca podemos apreciarla también en el rostro de Jesús, por su gesto con labios apretados, nariz contundente y cabellos de mechones entrelazados. En otro plano, tallados en bajorrelieve otros dos soldados cierran la composición circular en torno a Jesús y como fondo, esgrafiada, asoma una arquitectura manierista.
Juan de Anchieta (Azpeitia, Gipuzkoa, 15/03/1533 - Pamplona, 30/11/1588) fue un gran escultor y difusor del Romanismo, el arte manierista que imitaba las formas Miguel Angel. Se formó en Valladolid y trabajó en Astorga con el introductor del romanismo en España, Gaspar Becerra, para más tarde fijar su propio taller en Pamplona. Ya en su época creó escuela y tuvo un gran reconocimiento por la calidad de sus trabajos, que podemos encontrar en Tafalla, Zaragoza, Jaca, Bribiesca, Zumaia, Cáseda, Pamplona o Aoiz.
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